Das Kunstmuseum Thun präsentiert in jährlich vier bis fünf grossen Wechselausstellungen vorwiegend zeitgenössische Kunst. Aktuelle Positionen liefern dem Publikum wichtige Impulse und etablierten das Museum über die Region hinaus. Die Besucher und Besucherinnen begegnen im Kunstmuseum Thun äusserst vielfältigen, internationalen und nationalen Tendenzen.
In jährlichen thematischen Ausstellungen wird Einblick in die Sammlung geboten. Unter neuem Blickwinkel können so einzelne Werke immer wieder entdeckt werden. Gerade diese Sammlungsausstellungen ermöglichen immer wieder einen Dialog zwischen Kunst der Vergangenheit und Kunst der Gegenwart. Zeitgenössische Arbeiten werden auf ihre historischen Wurzeln hin untersucht. Dabei verfolgt das Museum den Anspruch, dem interessierten Publikum die Kunst ebenso klug wie vergnüglich näher zu bringen.
Gleichzeitig mit der Hauptausstellung wird im Projektraum enter jeweils eine eigene kleinere Ausstellung gezeigt. Es sind dies vor allem künstlerische Experimente oder Einblicke in aktuelle Forschungsansätze. Oftmals entstehen die Projekte in Kooperation mit Universitäten oder sozialen Organisationen.