Von internationalem Rang sind 12.000 Jahre alte Frauenfigurinen vom Petersfels bei Engen sowie die Beigaben der eisenzeitlichen Prunkgräber aus Kappel am Rhein und Ihringen am Kaiserstuhl, darunter die älteste Glasschale nördlich der Alpen. Von historischer Bedeutung ist ein Gepäckanhänger aus dem römischen Legionslager von Dangstetten mit der
Nennung des unglücklichen Feldherren Varus. Aus dem Frühmittelalter stechen kostbare Grabbeigaben hervor, allen voran Goldblattkreuze als erste Zeugnisse der Christianisierung am Oberrhein.
Die archäologischen Funde und die Lebensumstände der damaligen Menschen werden durch vielfältige museale Angebote erschlossen. Dazu gehören ein Panomarabild der eiszeitlichen Landschaft, eine begehbare Grabkammer,
Filme mit der Darstellung alter Techniken, Mitmach-Stationen, Touch-Screens und 3D-Simulationen.